境内有等级航道3条，三河、金宝航道、淮河入江水道。其中，三河航道，西接洪泽湖入淮河，东连金宝航道、淮河入江水道；金宝航道（6改3工程正在建设中）西接三河，东入大运河；淮河入江水道北接三河，南接高邮湖入大运河。